Introducción: La queratitis micótica es una de las principales causas de ceguera corneal. La terapia médica estándar recomendada para la queratitis micótica es la natamicina tópica al 5%. Sin embargo, tiene escasa penetración a través del epitelio corneal intacto, baja biodisponibilidad y tiempo de retención limitada. Por tanto, se recomienda el tratamiento con un antifúngico sistémico en casos de queratitis micótica grave, queratitis refractarias, escleritis, endoftalmitis y en casos de perforación inminente o úlceras corneales perforadas. Sin embargo, el papel de la terapia antifúngica oral en el tratamiento de la queratitis micótica no es concluyente. Objetivo: Comparar los resultados anatómicos y clínicos de Natamicina tópica versus Natamicina tópica combinada con antifúngico oral en el tratamiento de la queratitis micótica grave. Métodos: Estudio de cohorte retrospectiva. Se incluirán a pacientes con queratitis micótica grave atendidos en el Instituto Nacional de Oftalmología durante enero del 2019 a abril del 2022. Se recolectarán de la historia clínica datos demográficos, la agudeza visual mejor corregida inicial y final, tiempo de cierre del defecto epitelial, tiempo de resolución del hipopión, presencia de perforación corneal y si se realizó recubrimiento conjuntival. Se considerará como desenlace principal la variación del tamaño del defecto epitelial corneal. Para el análisis de comparación de los desenlaces categóricos entre ambos grupos se aplicará un test de Chi cuadrado. Para los desenlaces cuantitativos, se considerará la prueba de T-student para datos independientes si la distribución es normal, o la prueba de U de Mann-Whitney si los datos tienen distribución no paramétrica.