El virus de la hepatitis C es una de las causas más comunes de enfermedad hepática progresiva. En el Perú se calcula que existen alrededor de 300 000 pacientes infectados. La región utilizada para este trabajo es la 5' NCR la cual es altamente conservada y permite discriminar entre los seis tipos principales y los subtipos del virus. En el Perú es el primer trabajo de variabilidad genética del VHC, el cual se enfoca a través de un estudio epidemiológico, filogenético y evolutivo que contribuye con datos relevantes para nuestro país. En cuanto a la epidemiologia, se determinó los subtipos circulantes entre los años 2012 al 2014, los cuales fueron 1a (77.5 %), 1b (16.3%), 2a (1.6%), 2b (1.6%), 2c (1.6%) y 3a (1.6 %). El análisis filogenético utilizando las secuencias de Perú, mostró que se encuentran cercanamente agrupadas con las de América del Sur, América del Norte e Europa. Por último la historia evolutiva sugiere que el subtipo 1a tiene una larga historia evolutiva que comienza aproximadamente desde el año 1965, cuyo inicio de propagación se realiza en el año 2000 con un periodo de crecimiento exponencial hasta el año 2010, la cual después se mantiene en forma controlada.